https://www.lemonde.fr/sciences/article/2022/03/15/sequencer-l-adn-de-l-environnement-une-technique-qui-fait-sa-revolution_6117518_1650684.html
Permettant de suivre des espèces à partir des traces génétiques laissées dans leur sillage, l’ADN environnemental connaît un engouement sans précédent. Développée dans les années 2000, la technique s’ouvre aujourd’hui à de nouveaux champs d’application.
Une révolution dans l’air. En janvier, deux équipes indépendantes annonçaient avoir réussi à capter et séquencer de l’ADN présent dans l’atmosphère. En aspirant et filtrant l’air au beau milieu de deux parcs zoologiques européens, chaque équipe de recherche a identifié des traces ADN caractéristiques de dizaines d’espèces de mammifères, oiseaux ou reptiles desdits parcs. Cette prouesse, reproduite en milieu naturel et décrite dans une autre publication parue vendredi 11 mars, n’est que le dernier tour de force d’une jeune technique moléculaire qui ne cesse de repousser ses limites : l’ADN environnemental, ou ADNe.
Recenser tous les poissons, plantes et insectes d’un lac à partir de quelques litres d’eau, retracer la migration d’un papillon en récupérant sur son corps l’ADN des plantes qu’il a butinées, identifier les grenouilles d’une zone en séquençant les insectes qui les ont piquées… Ces études aux allures de tour de magie se comptent désormais par dizaines tous les mois, élargissant toujours plus le champ d’application de cet ADN environnemental, bien au-delà du simple outil de détection d’espèces qu’il était encore il y a quelques années.
« Les méthodes d’analyses sont complexes à maîtriser, mais le tout repose sur un principe très simple : les espèces vivantes laissent derrière elles des fragments d’ADN à travers les déjections, les poils, les écailles, la salive, l’urine… Ces fragments, que l’on extrait d’un échantillon de terre ou d’eau par exemple, constituent ce que l’on appelle l’ADNe », résume Pierre Taberlet, directeur de recherche émérite au CNRS.
